Thông tư 23/2025/TT-BTC (hiệu lực từ 01/7/2025) đã bổ sung khoản 1c vào Điều 10 Thông tư 328/2016/TT-BTC (đã được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư 72/2021/TT-BTC) quy định rõ nguyên tắc hạch toán trong trường hợp thu hồi số tiền hoàn thuế giá trị gia tăng đã hoàn theo pháp luật thuế.
Số tiền thu hồi được nộp vào năm ngân sách nào thì hạch toán giảm chi hoàn thuế giá trị gia tăng của năm ngân sách đó.

Bên cạnh đó, Thông tư 23/2025/TT-BTC cũng sửa đổi quy định về hạch toán hoàn trả ngân sách Nhà nước
Cụ thể, quy định mới xác định rõ hơn căn cứ thời điểm ban hành quyết định hoàn trả để thực hiện hạch toán:
– Nếu quyết định hoàn trả ban hành trong năm hiện hành, Kho bạc Nhà nước thực hiện hạch toán giảm thu ngân sách trong năm hiện hành, theo mục lục ngân sách của khoản hoàn trả.
– Nếu quyết định hoàn trả ban hành trong năm trước:
- Trường hợp hoàn trả trong thời gian chỉnh lý quyết toán: hạch toán giảm thu của năm trước.
- Trường hợp hoàn trả sau thời gian chỉnh lý quyết toán: hạch toán giảm thu của năm hiện hành.